専門職大学院（せんもんしょくだいがくいん）とは、「大学院のうち、学術の理論及び応用を教授研究し、高度の専門性が求められる職業を担うための深い学識及び卓越した能力を培うことを目的とするもの」のことである。
大学院は、学術の理論及び応用を教授研究し、その深奥をきわめ、又は高度の専門性が求められる職業を担うための深い学識及び卓越した能力を培い、文化の進展に寄与することを目的としている（学校教育法第99条第1項）。専門職大学院は、大学院のうち、高度専門職業人の養成などを行うものである。
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専門職大学院の課程は、「各大学におかれる大学院」に専門職学位課程をおくことで設けられる。専門職学位課程（専門職大学院の課程）の標準修業年限は、通例2年であるが、専攻分野の特性により特に必要があると認められる場合は、1年以上2年未満である。修了するには、各専門職大学院が定める30単位以上の修得その他の教育課程の履修により課程を修了することとされている。
専門職大学院には、担当する専門分野に関し高度の教育上の指導能力があると認められる専任教員を、専攻ごとに一定数置くものとされている。この専任教員には、博士の学位は、法令上は求められていない。しかし、従来の大学設置基準とは異なってファカルティ・ディベロプメントによる教員の能力開発が求められている。
専門職大学院であって、法曹に必要な学識及び能力を培うことを目的とするものは、法科大学院と呼ばれる。